Protein–RNA interactions for Protein: P50429

Arsb, Arylsulfatase B, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsbP50429 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArsbP50429 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArsbP50429 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArsbP50429 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArsbP50429 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArsbP50429 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArsbP50429 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArsbP50429 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArsbP50429 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArsbP50429 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArsbP50429 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArsbP50429 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArsbP50429 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ArsbP50429 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArsbP50429 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ArsbP50429 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArsbP50429 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ArsbP50429 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArsbP50429 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArsbP50429 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArsbP50429 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArsbP50429 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArsbP50429 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArsbP50429 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArsbP50429 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArsbP50429 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArsbP50429 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArsbP50429 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArsbP50429 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArsbP50429 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArsbP50429 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArsbP50429 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArsbP50429 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArsbP50429 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArsbP50429 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArsbP50429 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArsbP50429 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArsbP50429 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ArsbP50429 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArsbP50429 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArsbP50429 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArsbP50429 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArsbP50429 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArsbP50429 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArsbP50429 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArsbP50429 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArsbP50429 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ArsbP50429 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArsbP50429 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArsbP50429 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArsbP50429 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArsbP50429 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArsbP50429 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArsbP50429 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArsbP50429 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArsbP50429 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ArsbP50429 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArsbP50429 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArsbP50429 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArsbP50429 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ArsbP50429 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArsbP50429 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArsbP50429 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ArsbP50429 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArsbP50429 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArsbP50429 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArsbP50429 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArsbP50429 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ArsbP50429 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArsbP50429 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArsbP50429 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArsbP50429 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArsbP50429 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArsbP50429 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArsbP50429 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArsbP50429 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArsbP50429 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArsbP50429 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArsbP50429 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ArsbP50429 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ArsbP50429 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArsbP50429 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArsbP50429 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArsbP50429 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArsbP50429 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArsbP50429 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArsbP50429 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArsbP50429 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArsbP50429 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArsbP50429 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArsbP50429 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArsbP50429 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArsbP50429 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArsbP50429 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArsbP50429 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArsbP50429 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArsbP50429 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArsbP50429 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArsbP50429 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArsbP50429 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms