Protein–RNA interactions for Protein: P49182

Serpind1, Heparin cofactor 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpind1P49182 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Serpind1P49182 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Serpind1P49182 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Serpind1P49182 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Serpind1P49182 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Serpind1P49182 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Serpind1P49182 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Serpind1P49182 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Serpind1P49182 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Serpind1P49182 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Serpind1P49182 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Serpind1P49182 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Serpind1P49182 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Serpind1P49182 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Serpind1P49182 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Serpind1P49182 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Serpind1P49182 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Serpind1P49182 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Serpind1P49182 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Serpind1P49182 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Serpind1P49182 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpind1P49182 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpind1P49182 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpind1P49182 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpind1P49182 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpind1P49182 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Serpind1P49182 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Serpind1P49182 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Serpind1P49182 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Serpind1P49182 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Serpind1P49182 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Serpind1P49182 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Serpind1P49182 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpind1P49182 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpind1P49182 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpind1P49182 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpind1P49182 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpind1P49182 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpind1P49182 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpind1P49182 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Serpind1P49182 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpind1P49182 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Serpind1P49182 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Serpind1P49182 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Serpind1P49182 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpind1P49182 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpind1P49182 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Serpind1P49182 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Serpind1P49182 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpind1P49182 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Serpind1P49182 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Serpind1P49182 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpind1P49182 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpind1P49182 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpind1P49182 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpind1P49182 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Serpind1P49182 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Serpind1P49182 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Serpind1P49182 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Serpind1P49182 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpind1P49182 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpind1P49182 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Serpind1P49182 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Serpind1P49182 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Serpind1P49182 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Serpind1P49182 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Serpind1P49182 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpind1P49182 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serpind1P49182 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serpind1P49182 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serpind1P49182 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Serpind1P49182 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Serpind1P49182 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Serpind1P49182 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Serpind1P49182 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Serpind1P49182 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Serpind1P49182 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Serpind1P49182 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpind1P49182 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms