Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GdnfP48540 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GdnfP48540 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GdnfP48540 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GdnfP48540 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GdnfP48540 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GdnfP48540 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GdnfP48540 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GdnfP48540 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GdnfP48540 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GdnfP48540 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GdnfP48540 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GdnfP48540 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GdnfP48540 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GdnfP48540 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GdnfP48540 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GdnfP48540 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GdnfP48540 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GdnfP48540 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GdnfP48540 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GdnfP48540 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GdnfP48540 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GdnfP48540 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GdnfP48540 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GdnfP48540 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GdnfP48540 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GdnfP48540 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GdnfP48540 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GdnfP48540 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GdnfP48540 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GdnfP48540 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GdnfP48540 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GdnfP48540 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GdnfP48540 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GdnfP48540 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GdnfP48540 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GdnfP48540 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GdnfP48540 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GdnfP48540 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GdnfP48540 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GdnfP48540 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GdnfP48540 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GdnfP48540 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GdnfP48540 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GdnfP48540 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GdnfP48540 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GdnfP48540 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GdnfP48540 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GdnfP48540 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GdnfP48540 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GdnfP48540 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GdnfP48540 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GdnfP48540 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GdnfP48540 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GdnfP48540 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GdnfP48540 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GdnfP48540 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GdnfP48540 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GdnfP48540 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GdnfP48540 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GdnfP48540 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GdnfP48540 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms