Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtbP41155 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtbP41155 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbP41155 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LtbP41155 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbP41155 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LtbP41155 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LtbP41155 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LtbP41155 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LtbP41155 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbP41155 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LtbP41155 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbP41155 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LtbP41155 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LtbP41155 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LtbP41155 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LtbP41155 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbP41155 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbP41155 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbP41155 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LtbP41155 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbP41155 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LtbP41155 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LtbP41155 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbP41155 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbP41155 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LtbP41155 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LtbP41155 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbP41155 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbP41155 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LtbP41155 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LtbP41155 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LtbP41155 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LtbP41155 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LtbP41155 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbP41155 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LtbP41155 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbP41155 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LtbP41155 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbP41155 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtbP41155 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbP41155 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbP41155 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbP41155 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbP41155 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbP41155 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbP41155 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbP41155 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbP41155 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbP41155 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbP41155 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbP41155 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbP41155 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbP41155 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbP41155 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbP41155 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbP41155 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbP41155 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbP41155 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbP41155 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbP41155 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbP41155 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbP41155 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbP41155 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LtbP41155 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LtbP41155 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbP41155 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbP41155 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LtbP41155 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbP41155 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbP41155 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbP41155 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbP41155 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbP41155 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbP41155 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbP41155 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbP41155 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbP41155 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbP41155 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbP41155 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbP41155 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbP41155 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbP41155 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbP41155 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbP41155 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbP41155 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbP41155 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LtbP41155 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LtbP41155 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LtbP41155 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LtbP41155 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbP41155 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbP41155 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbP41155 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbP41155 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LtbP41155 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LtbP41155 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbP41155 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbP41155 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbP41155 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms