Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab18P35293 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab18P35293 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab18P35293 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab18P35293 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab18P35293 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab18P35293 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab18P35293 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab18P35293 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab18P35293 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab18P35293 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab18P35293 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab18P35293 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab18P35293 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab18P35293 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab18P35293 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab18P35293 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab18P35293 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab18P35293 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab18P35293 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab18P35293 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab18P35293 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab18P35293 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab18P35293 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab18P35293 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab18P35293 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab18P35293 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab18P35293 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab18P35293 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab18P35293 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab18P35293 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab18P35293 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab18P35293 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab18P35293 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab18P35293 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab18P35293 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab18P35293 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab18P35293 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab18P35293 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab18P35293 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab18P35293 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab18P35293 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab18P35293 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab18P35293 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab18P35293 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab18P35293 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab18P35293 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab18P35293 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab18P35293 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab18P35293 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab18P35293 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab18P35293 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab18P35293 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab18P35293 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab18P35293 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab18P35293 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab18P35293 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab18P35293 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab18P35293 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab18P35293 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab18P35293 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab18P35293 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab18P35293 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab18P35293 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab18P35293 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab18P35293 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab18P35293 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab18P35293 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab18P35293 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab18P35293 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab18P35293 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms