Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SarsP26638 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SarsP26638 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SarsP26638 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SarsP26638 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SarsP26638 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SarsP26638 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SarsP26638 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SarsP26638 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SarsP26638 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SarsP26638 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SarsP26638 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SarsP26638 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SarsP26638 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SarsP26638 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SarsP26638 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SarsP26638 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SarsP26638 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SarsP26638 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SarsP26638 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SarsP26638 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SarsP26638 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SarsP26638 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SarsP26638 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SarsP26638 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SarsP26638 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SarsP26638 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SarsP26638 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SarsP26638 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SarsP26638 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SarsP26638 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SarsP26638 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SarsP26638 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SarsP26638 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SarsP26638 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SarsP26638 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SarsP26638 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SarsP26638 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SarsP26638 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SarsP26638 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SarsP26638 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SarsP26638 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SarsP26638 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SarsP26638 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SarsP26638 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SarsP26638 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SarsP26638 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SarsP26638 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SarsP26638 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SarsP26638 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SarsP26638 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SarsP26638 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SarsP26638 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SarsP26638 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SarsP26638 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SarsP26638 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SarsP26638 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SarsP26638 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SarsP26638 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SarsP26638 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SarsP26638 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SarsP26638 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SarsP26638 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SarsP26638 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SarsP26638 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SarsP26638 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SarsP26638 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SarsP26638 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SarsP26638 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SarsP26638 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SarsP26638 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SarsP26638 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SarsP26638 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SarsP26638 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SarsP26638 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SarsP26638 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SarsP26638 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SarsP26638 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SarsP26638 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SarsP26638 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SarsP26638 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SarsP26638 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SarsP26638 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SarsP26638 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SarsP26638 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SarsP26638 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SarsP26638 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SarsP26638 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SarsP26638 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SarsP26638 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SarsP26638 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SarsP26638 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SarsP26638 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SarsP26638 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SarsP26638 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SarsP26638 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SarsP26638 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SarsP26638 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SarsP26638 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SarsP26638 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms