Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctnna1P26231 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctnna1P26231 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctnna1P26231 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctnna1P26231 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctnna1P26231 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctnna1P26231 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ctnna1P26231 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ctnna1P26231 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ctnna1P26231 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctnna1P26231 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctnna1P26231 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctnna1P26231 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ctnna1P26231 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctnna1P26231 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctnna1P26231 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctnna1P26231 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ctnna1P26231 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ctnna1P26231 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ctnna1P26231 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ctnna1P26231 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ctnna1P26231 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ctnna1P26231 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ctnna1P26231 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ctnna1P26231 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ctnna1P26231 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctnna1P26231 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ctnna1P26231 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ctnna1P26231 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctnna1P26231 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ctnna1P26231 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctnna1P26231 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctnna1P26231 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ctnna1P26231 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ctnna1P26231 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctnna1P26231 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ctnna1P26231 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ctnna1P26231 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctnna1P26231 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctnna1P26231 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctnna1P26231 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctnna1P26231 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctnna1P26231 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctnna1P26231 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctnna1P26231 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctnna1P26231 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctnna1P26231 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctnna1P26231 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctnna1P26231 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctnna1P26231 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctnna1P26231 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctnna1P26231 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctnna1P26231 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctnna1P26231 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctnna1P26231 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctnna1P26231 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctnna1P26231 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ctnna1P26231 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctnna1P26231 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctnna1P26231 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctnna1P26231 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctnna1P26231 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnna1P26231 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnna1P26231 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctnna1P26231 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctnna1P26231 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctnna1P26231 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctnna1P26231 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnna1P26231 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnna1P26231 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnna1P26231 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms