Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd48P18181 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd48P18181 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd48P18181 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd48P18181 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd48P18181 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd48P18181 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd48P18181 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd48P18181 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd48P18181 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd48P18181 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cd48P18181 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd48P18181 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd48P18181 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd48P18181 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd48P18181 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd48P18181 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd48P18181 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd48P18181 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd48P18181 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd48P18181 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd48P18181 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd48P18181 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd48P18181 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd48P18181 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd48P18181 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd48P18181 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd48P18181 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd48P18181 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd48P18181 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd48P18181 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd48P18181 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd48P18181 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd48P18181 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd48P18181 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd48P18181 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd48P18181 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd48P18181 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd48P18181 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd48P18181 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd48P18181 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd48P18181 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd48P18181 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd48P18181 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd48P18181 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd48P18181 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd48P18181 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd48P18181 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd48P18181 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cd48P18181 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd48P18181 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd48P18181 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd48P18181 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd48P18181 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd48P18181 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms