Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
ChgbP16014 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
ChgbP16014 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
ChgbP16014 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,85■■□□□ 1,73
ChgbP16014 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
ChgbP16014 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
ChgbP16014 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,72
ChgbP16014 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
ChgbP16014 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
ChgbP16014 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
ChgbP16014 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
ChgbP16014 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
ChgbP16014 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
ChgbP16014 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
ChgbP16014 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
ChgbP16014 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,74■■□□□ 1,71
ChgbP16014 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
ChgbP16014 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
ChgbP16014 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
ChgbP16014 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
ChgbP16014 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
ChgbP16014 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
ChgbP16014 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
ChgbP16014 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
ChgbP16014 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
ChgbP16014 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
ChgbP16014 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
ChgbP16014 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
ChgbP16014 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
ChgbP16014 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
ChgbP16014 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
ChgbP16014 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
ChgbP16014 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
ChgbP16014 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
ChgbP16014 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
ChgbP16014 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
ChgbP16014 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
ChgbP16014 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
ChgbP16014 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
ChgbP16014 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
ChgbP16014 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
ChgbP16014 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,54■■□□□ 1,68
ChgbP16014 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
ChgbP16014 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,51■■□□□ 1,67
ChgbP16014 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
ChgbP16014 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
ChgbP16014 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
ChgbP16014 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
ChgbP16014 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
ChgbP16014 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
ChgbP16014 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
ChgbP16014 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
ChgbP16014 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
ChgbP16014 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
ChgbP16014 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
ChgbP16014 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
ChgbP16014 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
ChgbP16014 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
ChgbP16014 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
ChgbP16014 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
ChgbP16014 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
ChgbP16014 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
ChgbP16014 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
ChgbP16014 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
ChgbP16014 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
ChgbP16014 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
ChgbP16014 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
ChgbP16014 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
ChgbP16014 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
ChgbP16014 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
ChgbP16014 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
ChgbP16014 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
ChgbP16014 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
ChgbP16014 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
ChgbP16014 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
ChgbP16014 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
ChgbP16014 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
ChgbP16014 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
ChgbP16014 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
ChgbP16014 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
ChgbP16014 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,16■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,16■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
ChgbP16014 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
ChgbP16014 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
ChgbP16014 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,13■■□□□ 1,61
ChgbP16014 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
ChgbP16014 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
ChgbP16014 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
ChgbP16014 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,5 ms