Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh2P15116 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh2P15116 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh2P15116 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh2P15116 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh2P15116 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh2P15116 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh2P15116 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh2P15116 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh2P15116 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh2P15116 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh2P15116 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdh2P15116 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh2P15116 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh2P15116 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh2P15116 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh2P15116 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh2P15116 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh2P15116 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh2P15116 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh2P15116 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh2P15116 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh2P15116 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh2P15116 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh2P15116 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh2P15116 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh2P15116 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh2P15116 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh2P15116 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdh2P15116 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdh2P15116 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh2P15116 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh2P15116 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh2P15116 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh2P15116 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh2P15116 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh2P15116 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh2P15116 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh2P15116 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh2P15116 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh2P15116 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh2P15116 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh2P15116 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh2P15116 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh2P15116 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh2P15116 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh2P15116 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh2P15116 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh2P15116 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh2P15116 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh2P15116 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdh2P15116 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdh2P15116 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh2P15116 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms