Protein–RNA interactions for Protein: P11214

Plat, Tissue-type plasminogen activator, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlatP11214 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PlatP11214 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PlatP11214 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PlatP11214 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PlatP11214 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PlatP11214 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PlatP11214 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PlatP11214 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PlatP11214 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PlatP11214 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PlatP11214 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PlatP11214 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PlatP11214 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PlatP11214 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PlatP11214 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PlatP11214 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PlatP11214 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PlatP11214 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PlatP11214 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PlatP11214 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PlatP11214 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PlatP11214 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PlatP11214 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PlatP11214 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PlatP11214 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PlatP11214 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PlatP11214 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PlatP11214 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PlatP11214 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PlatP11214 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PlatP11214 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PlatP11214 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PlatP11214 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PlatP11214 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PlatP11214 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PlatP11214 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PlatP11214 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PlatP11214 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PlatP11214 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PlatP11214 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PlatP11214 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PlatP11214 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PlatP11214 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PlatP11214 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PlatP11214 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PlatP11214 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PlatP11214 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PlatP11214 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PlatP11214 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PlatP11214 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PlatP11214 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PlatP11214 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PlatP11214 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PlatP11214 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PlatP11214 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PlatP11214 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PlatP11214 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PlatP11214 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PlatP11214 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PlatP11214 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PlatP11214 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PlatP11214 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PlatP11214 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PlatP11214 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PlatP11214 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PlatP11214 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PlatP11214 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PlatP11214 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PlatP11214 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PlatP11214 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PlatP11214 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PlatP11214 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PlatP11214 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PlatP11214 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PlatP11214 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PlatP11214 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PlatP11214 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PlatP11214 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PlatP11214 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PlatP11214 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PlatP11214 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PlatP11214 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PlatP11214 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PlatP11214 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PlatP11214 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PlatP11214 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PlatP11214 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PlatP11214 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PlatP11214 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PlatP11214 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PlatP11214 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PlatP11214 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PlatP11214 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PlatP11214 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PlatP11214 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PlatP11214 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PlatP11214 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PlatP11214 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PlatP11214 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PlatP11214 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms