Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbbP0CG49 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UbbP0CG49 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UbbP0CG49 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UbbP0CG49 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UbbP0CG49 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UbbP0CG49 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UbbP0CG49 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UbbP0CG49 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UbbP0CG49 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UbbP0CG49 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UbbP0CG49 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UbbP0CG49 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UbbP0CG49 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UbbP0CG49 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UbbP0CG49 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UbbP0CG49 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UbbP0CG49 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UbbP0CG49 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UbbP0CG49 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UbbP0CG49 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UbbP0CG49 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UbbP0CG49 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UbbP0CG49 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UbbP0CG49 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UbbP0CG49 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UbbP0CG49 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UbbP0CG49 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UbbP0CG49 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
UbbP0CG49 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UbbP0CG49 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UbbP0CG49 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UbbP0CG49 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UbbP0CG49 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UbbP0CG49 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UbbP0CG49 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UbbP0CG49 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UbbP0CG49 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UbbP0CG49 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UbbP0CG49 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UbbP0CG49 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UbbP0CG49 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UbbP0CG49 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UbbP0CG49 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UbbP0CG49 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UbbP0CG49 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms