Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XlrP05531 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
XlrP05531 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XlrP05531 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XlrP05531 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XlrP05531 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XlrP05531 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XlrP05531 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XlrP05531 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XlrP05531 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
XlrP05531 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XlrP05531 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XlrP05531 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XlrP05531 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XlrP05531 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XlrP05531 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XlrP05531 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
XlrP05531 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XlrP05531 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XlrP05531 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XlrP05531 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XlrP05531 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XlrP05531 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
XlrP05531 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XlrP05531 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
XlrP05531 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XlrP05531 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XlrP05531 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
XlrP05531 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XlrP05531 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XlrP05531 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
XlrP05531 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XlrP05531 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XlrP05531 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XlrP05531 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XlrP05531 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XlrP05531 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XlrP05531 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XlrP05531 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XlrP05531 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XlrP05531 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XlrP05531 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
XlrP05531 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XlrP05531 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XlrP05531 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XlrP05531 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XlrP05531 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XlrP05531 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XlrP05531 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XlrP05531 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XlrP05531 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XlrP05531 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XlrP05531 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XlrP05531 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XlrP05531 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
XlrP05531 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XlrP05531 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XlrP05531 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XlrP05531 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XlrP05531 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XlrP05531 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XlrP05531 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
XlrP05531 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XlrP05531 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XlrP05531 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XlrP05531 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XlrP05531 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XlrP05531 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XlrP05531 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
XlrP05531 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XlrP05531 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XlrP05531 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XlrP05531 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XlrP05531 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XlrP05531 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XlrP05531 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XlrP05531 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
XlrP05531 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XlrP05531 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XlrP05531 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XlrP05531 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XlrP05531 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XlrP05531 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XlrP05531 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XlrP05531 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
XlrP05531 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XlrP05531 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XlrP05531 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XlrP05531 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XlrP05531 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XlrP05531 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XlrP05531 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XlrP05531 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XlrP05531 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XlrP05531 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XlrP05531 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XlrP05531 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XlrP05531 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XlrP05531 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XlrP05531 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms