Protein–RNA interactions for Protein: P03985

T-cell receptor gamma chain C region C7.5, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03985 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
P03985 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
P03985 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,5■□□□□ 0,55
P03985 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18,49■□□□□ 0,55
P03985 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18,48■□□□□ 0,55
P03985 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,47■□□□□ 0,55
P03985 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,46■□□□□ 0,55
P03985 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,45■□□□□ 0,54
P03985 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
P03985 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,44■□□□□ 0,54
P03985 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
P03985 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
P03985 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
P03985 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
P03985 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
P03985 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18,42■□□□□ 0,54
P03985 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
P03985 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
P03985 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
P03985 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
P03985 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
P03985 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18,39■□□□□ 0,53
P03985 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18,38■□□□□ 0,53
P03985 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18,37■□□□□ 0,53
P03985 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
P03985 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
P03985 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,36■□□□□ 0,53
P03985 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
P03985 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
P03985 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
P03985 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
P03985 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,53
P03985 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18,32■□□□□ 0,52
P03985 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
P03985 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
P03985 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,31■□□□□ 0,52
P03985 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
P03985 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
P03985 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
P03985 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
P03985 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
P03985 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
P03985 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,29■□□□□ 0,52
P03985 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18,28■□□□□ 0,52
P03985 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18,28■□□□□ 0,52
P03985 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18,27■□□□□ 0,52
P03985 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
P03985 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18,26■□□□□ 0,51
P03985 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18,26■□□□□ 0,51
P03985 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
P03985 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
P03985 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
P03985 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
P03985 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
P03985 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
P03985 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,2■□□□□ 0,5
P03985 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
P03985 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
P03985 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18,19■□□□□ 0,5
P03985 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
P03985 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
P03985 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
P03985 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
P03985 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
P03985 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
P03985 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
P03985 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
P03985 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
P03985 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
P03985 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
P03985 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
P03985 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
P03985 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
P03985 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
P03985 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
P03985 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
P03985 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,12■□□□□ 0,49
P03985 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18,12■□□□□ 0,49
P03985 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,12■□□□□ 0,49
P03985 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
P03985 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
P03985 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
P03985 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
P03985 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,09■□□□□ 0,49
P03985 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,09■□□□□ 0,49
P03985 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18,08■□□□□ 0,49
P03985 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
P03985 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18,07■□□□□ 0,48
P03985 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18,06■□□□□ 0,48
P03985 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
P03985 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
P03985 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
P03985 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
P03985 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
P03985 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
P03985 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
P03985 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
P03985 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
P03985 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
P03985 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms