Protein–RNA interactions for Protein: P02716

Chrnd, Acetylcholine receptor subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrndP02716 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChrndP02716 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChrndP02716 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChrndP02716 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChrndP02716 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChrndP02716 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChrndP02716 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChrndP02716 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ChrndP02716 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ChrndP02716 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChrndP02716 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChrndP02716 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChrndP02716 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChrndP02716 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChrndP02716 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChrndP02716 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChrndP02716 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChrndP02716 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChrndP02716 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChrndP02716 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChrndP02716 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChrndP02716 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChrndP02716 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChrndP02716 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChrndP02716 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChrndP02716 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChrndP02716 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChrndP02716 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChrndP02716 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChrndP02716 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChrndP02716 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChrndP02716 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChrndP02716 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChrndP02716 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChrndP02716 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChrndP02716 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChrndP02716 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChrndP02716 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChrndP02716 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChrndP02716 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChrndP02716 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChrndP02716 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChrndP02716 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChrndP02716 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChrndP02716 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChrndP02716 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChrndP02716 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChrndP02716 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChrndP02716 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChrndP02716 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChrndP02716 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChrndP02716 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChrndP02716 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChrndP02716 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ChrndP02716 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChrndP02716 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChrndP02716 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChrndP02716 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ChrndP02716 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChrndP02716 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChrndP02716 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChrndP02716 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChrndP02716 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChrndP02716 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChrndP02716 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChrndP02716 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChrndP02716 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms