Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ClppO88696 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ClppO88696 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ClppO88696 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ClppO88696 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ClppO88696 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ClppO88696 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ClppO88696 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ClppO88696 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ClppO88696 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ClppO88696 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ClppO88696 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ClppO88696 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ClppO88696 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClppO88696 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClppO88696 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClppO88696 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClppO88696 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClppO88696 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClppO88696 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClppO88696 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClppO88696 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClppO88696 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ClppO88696 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ClppO88696 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ClppO88696 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ClppO88696 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ClppO88696 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ClppO88696 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClppO88696 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClppO88696 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClppO88696 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClppO88696 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ClppO88696 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ClppO88696 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClppO88696 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClppO88696 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ClppO88696 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ClppO88696 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ClppO88696 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ClppO88696 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ClppO88696 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ClppO88696 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ClppO88696 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ClppO88696 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClppO88696 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClppO88696 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClppO88696 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ClppO88696 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ClppO88696 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ClppO88696 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClppO88696 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClppO88696 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClppO88696 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClppO88696 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClppO88696 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClppO88696 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClppO88696 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClppO88696 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClppO88696 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClppO88696 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ClppO88696 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ClppO88696 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ClppO88696 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ClppO88696 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ClppO88696 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ClppO88696 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClppO88696 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClppO88696 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ClppO88696 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ClppO88696 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ClppO88696 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ClppO88696 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClppO88696 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ClppO88696 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ClppO88696 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ClppO88696 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClppO88696 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClppO88696 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClppO88696 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClppO88696 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ClppO88696 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClppO88696 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClppO88696 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ClppO88696 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ClppO88696 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ClppO88696 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClppO88696 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClppO88696 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClppO88696 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClppO88696 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClppO88696 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ClppO88696 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ClppO88696 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClppO88696 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ClppO88696 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClppO88696 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClppO88696 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClppO88696 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClppO88696 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms