Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capns1O88456 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capns1O88456 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capns1O88456 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capns1O88456 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capns1O88456 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capns1O88456 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capns1O88456 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capns1O88456 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capns1O88456 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Capns1O88456 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capns1O88456 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capns1O88456 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capns1O88456 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capns1O88456 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capns1O88456 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capns1O88456 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capns1O88456 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capns1O88456 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capns1O88456 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Capns1O88456 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capns1O88456 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capns1O88456 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capns1O88456 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Capns1O88456 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capns1O88456 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capns1O88456 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capns1O88456 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capns1O88456 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capns1O88456 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capns1O88456 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Capns1O88456 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capns1O88456 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capns1O88456 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capns1O88456 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capns1O88456 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capns1O88456 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capns1O88456 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Capns1O88456 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capns1O88456 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capns1O88456 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capns1O88456 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capns1O88456 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capns1O88456 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capns1O88456 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capns1O88456 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Capns1O88456 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capns1O88456 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capns1O88456 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capns1O88456 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capns1O88456 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capns1O88456 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capns1O88456 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capns1O88456 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capns1O88456 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capns1O88456 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capns1O88456 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capns1O88456 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capns1O88456 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capns1O88456 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capns1O88456 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capns1O88456 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms