Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcnk4O88454 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnk4O88454 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnk4O88454 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnk4O88454 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kcnk4O88454 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnk4O88454 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnk4O88454 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnk4O88454 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnk4O88454 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnk4O88454 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnk4O88454 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnk4O88454 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnk4O88454 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnk4O88454 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnk4O88454 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnk4O88454 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcnk4O88454 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnk4O88454 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnk4O88454 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnk4O88454 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kcnk4O88454 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnk4O88454 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnk4O88454 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnk4O88454 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnk4O88454 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnk4O88454 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnk4O88454 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnk4O88454 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnk4O88454 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnk4O88454 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnk4O88454 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnk4O88454 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnk4O88454 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnk4O88454 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnk4O88454 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnk4O88454 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnk4O88454 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnk4O88454 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnk4O88454 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnk4O88454 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnk4O88454 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnk4O88454 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnk4O88454 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnk4O88454 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnk4O88454 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnk4O88454 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnk4O88454 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnk4O88454 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnk4O88454 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnk4O88454 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnk4O88454 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnk4O88454 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnk4O88454 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnk4O88454 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnk4O88454 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnk4O88454 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnk4O88454 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnk4O88454 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnk4O88454 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnk4O88454 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnk4O88454 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnk4O88454 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnk4O88454 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnk4O88454 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnk4O88454 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnk4O88454 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnk4O88454 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnk4O88454 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnk4O88454 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnk4O88454 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnk4O88454 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnk4O88454 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnk4O88454 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnk4O88454 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnk4O88454 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnk4O88454 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnk4O88454 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnk4O88454 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnk4O88454 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnk4O88454 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnk4O88454 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnk4O88454 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms