Protein–RNA interactions for Protein: O88396

Grpel2, GrpE protein homolog 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel2O88396 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grpel2O88396 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grpel2O88396 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grpel2O88396 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grpel2O88396 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grpel2O88396 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grpel2O88396 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grpel2O88396 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grpel2O88396 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grpel2O88396 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Grpel2O88396 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grpel2O88396 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Grpel2O88396 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grpel2O88396 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grpel2O88396 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grpel2O88396 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grpel2O88396 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grpel2O88396 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grpel2O88396 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grpel2O88396 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grpel2O88396 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grpel2O88396 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grpel2O88396 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grpel2O88396 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grpel2O88396 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grpel2O88396 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grpel2O88396 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grpel2O88396 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Grpel2O88396 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grpel2O88396 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grpel2O88396 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grpel2O88396 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grpel2O88396 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grpel2O88396 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grpel2O88396 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grpel2O88396 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grpel2O88396 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grpel2O88396 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grpel2O88396 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grpel2O88396 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grpel2O88396 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grpel2O88396 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grpel2O88396 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grpel2O88396 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grpel2O88396 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grpel2O88396 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grpel2O88396 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grpel2O88396 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grpel2O88396 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grpel2O88396 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grpel2O88396 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grpel2O88396 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grpel2O88396 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grpel2O88396 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grpel2O88396 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grpel2O88396 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grpel2O88396 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grpel2O88396 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grpel2O88396 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grpel2O88396 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grpel2O88396 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grpel2O88396 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms