Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
NlkO54949 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
NlkO54949 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
NlkO54949 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
NlkO54949 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
NlkO54949 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
NlkO54949 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
NlkO54949 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
NlkO54949 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
NlkO54949 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
NlkO54949 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
NlkO54949 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
NlkO54949 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
NlkO54949 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
NlkO54949 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
NlkO54949 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
NlkO54949 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
NlkO54949 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
NlkO54949 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
NlkO54949 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
NlkO54949 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
NlkO54949 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
NlkO54949 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
NlkO54949 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
NlkO54949 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
NlkO54949 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
NlkO54949 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
NlkO54949 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
NlkO54949 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
NlkO54949 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
NlkO54949 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
NlkO54949 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
NlkO54949 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
NlkO54949 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
NlkO54949 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22,74■■□□□ 1,23
NlkO54949 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
NlkO54949 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
NlkO54949 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
NlkO54949 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,73■■□□□ 1,23
NlkO54949 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,71■■□□□ 1,23
NlkO54949 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,69■■□□□ 1,22
NlkO54949 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
NlkO54949 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
NlkO54949 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
NlkO54949 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
NlkO54949 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,22
NlkO54949 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
NlkO54949 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
NlkO54949 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,63■■□□□ 1,21
NlkO54949 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
NlkO54949 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
NlkO54949 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
NlkO54949 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
NlkO54949 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
NlkO54949 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,59■■□□□ 1,21
NlkO54949 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22,59■■□□□ 1,21
NlkO54949 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
NlkO54949 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,59■■□□□ 1,21
NlkO54949 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
NlkO54949 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
NlkO54949 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
NlkO54949 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
NlkO54949 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
NlkO54949 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
NlkO54949 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
NlkO54949 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22,52■■□□□ 1,2
NlkO54949 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
NlkO54949 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
NlkO54949 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
NlkO54949 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
NlkO54949 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
NlkO54949 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
NlkO54949 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
NlkO54949 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
NlkO54949 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
NlkO54949 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22,46■■□□□ 1,19
NlkO54949 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
NlkO54949 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22,45■■□□□ 1,18
NlkO54949 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
NlkO54949 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
NlkO54949 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22,43■■□□□ 1,18
NlkO54949 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22,43■■□□□ 1,18
NlkO54949 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
NlkO54949 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
NlkO54949 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
NlkO54949 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
NlkO54949 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22,39■■□□□ 1,18
NlkO54949 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
NlkO54949 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
NlkO54949 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
NlkO54949 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22,37■■□□□ 1,17
NlkO54949 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,37■■□□□ 1,17
NlkO54949 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
NlkO54949 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
NlkO54949 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
NlkO54949 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
NlkO54949 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
NlkO54949 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,34■■□□□ 1,17
NlkO54949 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
NlkO54949 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms