Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clk4O35493 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clk4O35493 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clk4O35493 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clk4O35493 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clk4O35493 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Clk4O35493 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clk4O35493 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clk4O35493 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clk4O35493 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clk4O35493 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clk4O35493 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Clk4O35493 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clk4O35493 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clk4O35493 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clk4O35493 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clk4O35493 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clk4O35493 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clk4O35493 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clk4O35493 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clk4O35493 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clk4O35493 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clk4O35493 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clk4O35493 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clk4O35493 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clk4O35493 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clk4O35493 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clk4O35493 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clk4O35493 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clk4O35493 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clk4O35493 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clk4O35493 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clk4O35493 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk4O35493 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk4O35493 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk4O35493 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clk4O35493 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clk4O35493 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clk4O35493 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clk4O35493 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clk4O35493 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clk4O35493 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clk4O35493 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clk4O35493 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clk4O35493 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clk4O35493 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clk4O35493 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clk4O35493 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clk4O35493 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clk4O35493 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clk4O35493 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clk4O35493 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk4O35493 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk4O35493 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk4O35493 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk4O35493 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk4O35493 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clk4O35493 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clk4O35493 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk4O35493 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk4O35493 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk4O35493 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clk4O35493 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clk4O35493 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk4O35493 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clk4O35493 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clk4O35493 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clk4O35493 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk4O35493 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk4O35493 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk4O35493 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clk4O35493 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clk4O35493 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clk4O35493 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clk4O35493 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clk4O35493 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clk4O35493 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clk4O35493 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms