Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clk3O35492 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clk3O35492 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clk3O35492 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clk3O35492 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Clk3O35492 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clk3O35492 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clk3O35492 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clk3O35492 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clk3O35492 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clk3O35492 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk3O35492 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk3O35492 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clk3O35492 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clk3O35492 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clk3O35492 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clk3O35492 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clk3O35492 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clk3O35492 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clk3O35492 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clk3O35492 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clk3O35492 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clk3O35492 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clk3O35492 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clk3O35492 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clk3O35492 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clk3O35492 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clk3O35492 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clk3O35492 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clk3O35492 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clk3O35492 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clk3O35492 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clk3O35492 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk3O35492 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clk3O35492 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clk3O35492 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clk3O35492 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clk3O35492 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clk3O35492 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clk3O35492 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk3O35492 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clk3O35492 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Clk3O35492 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clk3O35492 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clk3O35492 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clk3O35492 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clk3O35492 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clk3O35492 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clk3O35492 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clk3O35492 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clk3O35492 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clk3O35492 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clk3O35492 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clk3O35492 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clk3O35492 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clk3O35492 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clk3O35492 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clk3O35492 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clk3O35492 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk3O35492 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clk3O35492 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clk3O35492 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clk3O35492 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Clk3O35492 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms