Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube3aO08759 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ube3aO08759 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube3aO08759 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube3aO08759 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ube3aO08759 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ube3aO08759 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ube3aO08759 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ube3aO08759 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube3aO08759 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube3aO08759 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube3aO08759 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube3aO08759 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube3aO08759 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube3aO08759 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube3aO08759 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube3aO08759 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube3aO08759 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube3aO08759 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube3aO08759 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ube3aO08759 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ube3aO08759 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ube3aO08759 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ube3aO08759 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ube3aO08759 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube3aO08759 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube3aO08759 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube3aO08759 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ube3aO08759 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ube3aO08759 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ube3aO08759 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ube3aO08759 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ube3aO08759 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ube3aO08759 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3aO08759 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3aO08759 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3aO08759 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3aO08759 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube3aO08759 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ube3aO08759 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ube3aO08759 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube3aO08759 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube3aO08759 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube3aO08759 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube3aO08759 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube3aO08759 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube3aO08759 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube3aO08759 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ube3aO08759 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube3aO08759 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ube3aO08759 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ube3aO08759 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ube3aO08759 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ube3aO08759 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube3aO08759 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube3aO08759 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube3aO08759 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube3aO08759 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube3aO08759 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube3aO08759 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube3aO08759 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube3aO08759 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ube3aO08759 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ube3aO08759 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ube3aO08759 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ube3aO08759 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ube3aO08759 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ube3aO08759 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ube3aO08759 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ube3aO08759 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ube3aO08759 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ube3aO08759 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ube3aO08759 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ube3aO08759 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ube3aO08759 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ube3aO08759 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ube3aO08759 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ube3aO08759 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ube3aO08759 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Ube3aO08759 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms