Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8050L7N2E3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8050L7N2E3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8050L7N2E3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8050L7N2E3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm8050L7N2E3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8050L7N2E3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8050L7N2E3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8050L7N2E3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8050L7N2E3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8050L7N2E3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8050L7N2E3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8050L7N2E3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8050L7N2E3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8050L7N2E3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8050L7N2E3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8050L7N2E3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8050L7N2E3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8050L7N2E3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8050L7N2E3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8050L7N2E3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8050L7N2E3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8050L7N2E3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8050L7N2E3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8050L7N2E3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8050L7N2E3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8050L7N2E3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8050L7N2E3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8050L7N2E3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8050L7N2E3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8050L7N2E3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8050L7N2E3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8050L7N2E3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8050L7N2E3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8050L7N2E3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8050L7N2E3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8050L7N2E3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8050L7N2E3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8050L7N2E3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8050L7N2E3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8050L7N2E3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8050L7N2E3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8050L7N2E3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8050L7N2E3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8050L7N2E3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8050L7N2E3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8050L7N2E3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8050L7N2E3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms