Protein–RNA interactions for Protein: L7N285

Gm3115, Predicted gene 3115, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3115L7N285 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3115L7N285 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3115L7N285 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3115L7N285 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3115L7N285 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3115L7N285 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3115L7N285 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3115L7N285 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3115L7N285 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3115L7N285 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm3115L7N285 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3115L7N285 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3115L7N285 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3115L7N285 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3115L7N285 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3115L7N285 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3115L7N285 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3115L7N285 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3115L7N285 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3115L7N285 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3115L7N285 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3115L7N285 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3115L7N285 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3115L7N285 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3115L7N285 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3115L7N285 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3115L7N285 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3115L7N285 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm3115L7N285 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3115L7N285 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3115L7N285 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3115L7N285 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3115L7N285 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3115L7N285 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3115L7N285 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3115L7N285 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3115L7N285 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3115L7N285 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3115L7N285 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3115L7N285 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3115L7N285 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3115L7N285 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3115L7N285 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3115L7N285 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3115L7N285 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3115L7N285 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3115L7N285 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3115L7N285 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3115L7N285 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3115L7N285 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3115L7N285 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3115L7N285 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3115L7N285 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3115L7N285 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3115L7N285 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3115L7N285 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3115L7N285 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm3115L7N285 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3115L7N285 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3115L7N285 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3115L7N285 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3115L7N285 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3115L7N285 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3115L7N285 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3115L7N285 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3115L7N285 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3115L7N285 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3115L7N285 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3115L7N285 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3115L7N285 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3115L7N285 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3115L7N285 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3115L7N285 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3115L7N285 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3115L7N285 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3115L7N285 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3115L7N285 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3115L7N285 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3115L7N285 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms