Protein–RNA interactions for Protein: L7N253

4930555G01Rik, RIKEN cDNA 4930555G01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930555G01RikL7N253 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930555G01RikL7N253 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930555G01RikL7N253 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930555G01RikL7N253 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930555G01RikL7N253 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930555G01RikL7N253 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930555G01RikL7N253 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930555G01RikL7N253 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930555G01RikL7N253 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930555G01RikL7N253 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
4930555G01RikL7N253 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930555G01RikL7N253 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930555G01RikL7N253 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930555G01RikL7N253 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930555G01RikL7N253 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930555G01RikL7N253 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930555G01RikL7N253 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930555G01RikL7N253 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930555G01RikL7N253 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930555G01RikL7N253 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930555G01RikL7N253 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930555G01RikL7N253 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930555G01RikL7N253 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930555G01RikL7N253 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930555G01RikL7N253 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930555G01RikL7N253 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930555G01RikL7N253 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930555G01RikL7N253 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930555G01RikL7N253 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930555G01RikL7N253 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930555G01RikL7N253 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930555G01RikL7N253 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930555G01RikL7N253 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930555G01RikL7N253 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930555G01RikL7N253 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930555G01RikL7N253 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930555G01RikL7N253 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930555G01RikL7N253 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930555G01RikL7N253 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930555G01RikL7N253 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930555G01RikL7N253 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930555G01RikL7N253 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930555G01RikL7N253 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930555G01RikL7N253 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930555G01RikL7N253 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930555G01RikL7N253 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930555G01RikL7N253 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930555G01RikL7N253 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930555G01RikL7N253 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930555G01RikL7N253 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms