Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3248K7N721 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3248K7N721 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3248K7N721 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3248K7N721 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3248K7N721 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3248K7N721 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3248K7N721 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3248K7N721 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3248K7N721 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3248K7N721 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3248K7N721 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3248K7N721 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3248K7N721 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3248K7N721 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm3248K7N721 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3248K7N721 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3248K7N721 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3248K7N721 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3248K7N721 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3248K7N721 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3248K7N721 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3248K7N721 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3248K7N721 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3248K7N721 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3248K7N721 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3248K7N721 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3248K7N721 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3248K7N721 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3248K7N721 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3248K7N721 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3248K7N721 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3248K7N721 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3248K7N721 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3248K7N721 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3248K7N721 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3248K7N721 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3248K7N721 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3248K7N721 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3248K7N721 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3248K7N721 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3248K7N721 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3248K7N721 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3248K7N721 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3248K7N721 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3248K7N721 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3248K7N721 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3248K7N721 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3248K7N721 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3248K7N721 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3248K7N721 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3248K7N721 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3248K7N721 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3248K7N721 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3248K7N721 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3248K7N721 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3248K7N721 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3248K7N721 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3248K7N721 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3248K7N721 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3248K7N721 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3248K7N721 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3248K7N721 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3248K7N721 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3248K7N721 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3248K7N721 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3248K7N721 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3248K7N721 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3248K7N721 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3248K7N721 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3248K7N721 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3248K7N721 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3248K7N721 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3248K7N721 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3248K7N721 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3248K7N721 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms