Protein–RNA interactions for Protein: H3BKJ1

Gm20683, Predicted gene 20683 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20683H3BKJ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm20683H3BKJ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20683H3BKJ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20683H3BKJ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20683H3BKJ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20683H3BKJ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20683H3BKJ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20683H3BKJ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20683H3BKJ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20683H3BKJ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20683H3BKJ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20683H3BKJ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20683H3BKJ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20683H3BKJ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20683H3BKJ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20683H3BKJ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20683H3BKJ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20683H3BKJ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20683H3BKJ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20683H3BKJ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20683H3BKJ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20683H3BKJ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20683H3BKJ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20683H3BKJ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20683H3BKJ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20683H3BKJ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20683H3BKJ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20683H3BKJ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20683H3BKJ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20683H3BKJ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20683H3BKJ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20683H3BKJ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20683H3BKJ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20683H3BKJ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20683H3BKJ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20683H3BKJ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20683H3BKJ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20683H3BKJ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20683H3BKJ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20683H3BKJ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20683H3BKJ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20683H3BKJ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20683H3BKJ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20683H3BKJ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20683H3BKJ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20683H3BKJ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20683H3BKJ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20683H3BKJ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20683H3BKJ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20683H3BKJ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20683H3BKJ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20683H3BKJ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20683H3BKJ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20683H3BKJ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20683H3BKJ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20683H3BKJ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20683H3BKJ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20683H3BKJ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20683H3BKJ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20683H3BKJ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20683H3BKJ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20683H3BKJ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20683H3BKJ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20683H3BKJ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20683H3BKJ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20683H3BKJ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20683H3BKJ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm20683H3BKJ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20683H3BKJ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20683H3BKJ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20683H3BKJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20683H3BKJ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20683H3BKJ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20683H3BKJ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20683H3BKJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20683H3BKJ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20683H3BKJ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms