Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9a3G3X939 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc9a3G3X939 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9a3G3X939 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9a3G3X939 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc9a3G3X939 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc9a3G3X939 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc9a3G3X939 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc9a3G3X939 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc9a3G3X939 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc9a3G3X939 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc9a3G3X939 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc9a3G3X939 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc9a3G3X939 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc9a3G3X939 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc9a3G3X939 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc9a3G3X939 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc9a3G3X939 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc9a3G3X939 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc9a3G3X939 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc9a3G3X939 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc9a3G3X939 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc9a3G3X939 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc9a3G3X939 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc9a3G3X939 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc9a3G3X939 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9a3G3X939 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9a3G3X939 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc9a3G3X939 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc9a3G3X939 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc9a3G3X939 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc9a3G3X939 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc9a3G3X939 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc9a3G3X939 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc9a3G3X939 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc9a3G3X939 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc9a3G3X939 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc9a3G3X939 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc9a3G3X939 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc9a3G3X939 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc9a3G3X939 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc9a3G3X939 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc9a3G3X939 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc9a3G3X939 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc9a3G3X939 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc9a3G3X939 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc9a3G3X939 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc9a3G3X939 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc9a3G3X939 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc9a3G3X939 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a3G3X939 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc9a3G3X939 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc9a3G3X939 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc9a3G3X939 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc9a3G3X939 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc9a3G3X939 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc9a3G3X939 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc9a3G3X939 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc9a3G3X939 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc9a3G3X939 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc9a3G3X939 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a3G3X939 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc9a3G3X939 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc9a3G3X939 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc9a3G3X939 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms