Protein–RNA interactions for Protein: G3UVW3

Slc38a6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a6G3UVW3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc38a6G3UVW3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc38a6G3UVW3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc38a6G3UVW3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc38a6G3UVW3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc38a6G3UVW3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc38a6G3UVW3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc38a6G3UVW3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc38a6G3UVW3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc38a6G3UVW3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc38a6G3UVW3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc38a6G3UVW3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc38a6G3UVW3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc38a6G3UVW3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc38a6G3UVW3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc38a6G3UVW3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc38a6G3UVW3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc38a6G3UVW3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc38a6G3UVW3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc38a6G3UVW3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc38a6G3UVW3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc38a6G3UVW3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc38a6G3UVW3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a6G3UVW3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a6G3UVW3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a6G3UVW3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc38a6G3UVW3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a6G3UVW3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a6G3UVW3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a6G3UVW3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a6G3UVW3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a6G3UVW3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a6G3UVW3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a6G3UVW3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a6G3UVW3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a6G3UVW3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a6G3UVW3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a6G3UVW3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a6G3UVW3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a6G3UVW3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a6G3UVW3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a6G3UVW3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a6G3UVW3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a6G3UVW3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a6G3UVW3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc38a6G3UVW3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a6G3UVW3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a6G3UVW3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a6G3UVW3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a6G3UVW3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a6G3UVW3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a6G3UVW3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a6G3UVW3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms