Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8A4

Fbxw28, F-box and WD-40 domain protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw28E9Q8A4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxw28E9Q8A4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxw28E9Q8A4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxw28E9Q8A4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxw28E9Q8A4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxw28E9Q8A4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxw28E9Q8A4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxw28E9Q8A4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxw28E9Q8A4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxw28E9Q8A4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxw28E9Q8A4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxw28E9Q8A4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxw28E9Q8A4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxw28E9Q8A4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxw28E9Q8A4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxw28E9Q8A4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxw28E9Q8A4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxw28E9Q8A4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxw28E9Q8A4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxw28E9Q8A4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxw28E9Q8A4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxw28E9Q8A4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxw28E9Q8A4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxw28E9Q8A4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxw28E9Q8A4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxw28E9Q8A4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxw28E9Q8A4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxw28E9Q8A4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxw28E9Q8A4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxw28E9Q8A4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxw28E9Q8A4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxw28E9Q8A4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxw28E9Q8A4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxw28E9Q8A4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxw28E9Q8A4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxw28E9Q8A4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxw28E9Q8A4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxw28E9Q8A4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxw28E9Q8A4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxw28E9Q8A4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxw28E9Q8A4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxw28E9Q8A4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxw28E9Q8A4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxw28E9Q8A4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxw28E9Q8A4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxw28E9Q8A4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxw28E9Q8A4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxw28E9Q8A4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fbxw28E9Q8A4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxw28E9Q8A4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxw28E9Q8A4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxw28E9Q8A4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxw28E9Q8A4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxw28E9Q8A4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxw28E9Q8A4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxw28E9Q8A4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxw28E9Q8A4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxw28E9Q8A4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxw28E9Q8A4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxw28E9Q8A4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxw28E9Q8A4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxw28E9Q8A4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxw28E9Q8A4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxw28E9Q8A4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxw28E9Q8A4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxw28E9Q8A4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxw28E9Q8A4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxw28E9Q8A4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxw28E9Q8A4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxw28E9Q8A4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxw28E9Q8A4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxw28E9Q8A4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxw28E9Q8A4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxw28E9Q8A4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxw28E9Q8A4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxw28E9Q8A4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxw28E9Q8A4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxw28E9Q8A4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms