Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Parp4E9PYK3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Parp4E9PYK3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Parp4E9PYK3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Parp4E9PYK3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Parp4E9PYK3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Parp4E9PYK3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Parp4E9PYK3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Parp4E9PYK3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Parp4E9PYK3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Parp4E9PYK3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Parp4E9PYK3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Parp4E9PYK3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Parp4E9PYK3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Parp4E9PYK3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Parp4E9PYK3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,46■■□□□ 1,51
Parp4E9PYK3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Parp4E9PYK3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Parp4E9PYK3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Parp4E9PYK3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,35■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Parp4E9PYK3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Parp4E9PYK3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Parp4E9PYK3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Parp4E9PYK3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Parp4E9PYK3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,27■■□□□ 1,48
Parp4E9PYK3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Parp4E9PYK3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Parp4E9PYK3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Parp4E9PYK3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Parp4E9PYK3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Parp4E9PYK3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Parp4E9PYK3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Parp4E9PYK3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Parp4E9PYK3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Parp4E9PYK3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Parp4E9PYK3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Parp4E9PYK3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Parp4E9PYK3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Parp4E9PYK3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24,12■■□□□ 1,45
Parp4E9PYK3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Parp4E9PYK3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Parp4E9PYK3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Parp4E9PYK3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Parp4E9PYK3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Parp4E9PYK3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Parp4E9PYK3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Parp4E9PYK3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Parp4E9PYK3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Parp4E9PYK3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Parp4E9PYK3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Parp4E9PYK3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,43
Parp4E9PYK3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Parp4E9PYK3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Parp4E9PYK3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Parp4E9PYK3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Parp4E9PYK3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Parp4E9PYK3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Parp4E9PYK3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Parp4E9PYK3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Parp4E9PYK3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Parp4E9PYK3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Parp4E9PYK3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Parp4E9PYK3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Parp4E9PYK3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Parp4E9PYK3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
Parp4E9PYK3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Parp4E9PYK3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Parp4E9PYK3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,42
Parp4E9PYK3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Parp4E9PYK3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Parp4E9PYK3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Parp4E9PYK3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Parp4E9PYK3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Parp4E9PYK3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Parp4E9PYK3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Parp4E9PYK3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Parp4E9PYK3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Parp4E9PYK3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Parp4E9PYK3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,1 ms