Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zbed5B2RPU8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbed5B2RPU8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed5B2RPU8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed5B2RPU8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed5B2RPU8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbed5B2RPU8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbed5B2RPU8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbed5B2RPU8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed5B2RPU8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed5B2RPU8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed5B2RPU8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed5B2RPU8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zbed5B2RPU8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zbed5B2RPU8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zbed5B2RPU8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbed5B2RPU8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbed5B2RPU8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zbed5B2RPU8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbed5B2RPU8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbed5B2RPU8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbed5B2RPU8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbed5B2RPU8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbed5B2RPU8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbed5B2RPU8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbed5B2RPU8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zbed5B2RPU8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbed5B2RPU8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbed5B2RPU8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zbed5B2RPU8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbed5B2RPU8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbed5B2RPU8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbed5B2RPU8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbed5B2RPU8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbed5B2RPU8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zbed5B2RPU8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zbed5B2RPU8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zbed5B2RPU8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbed5B2RPU8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbed5B2RPU8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zbed5B2RPU8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Zbed5B2RPU8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Zbed5B2RPU8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbed5B2RPU8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbed5B2RPU8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbed5B2RPU8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbed5B2RPU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbed5B2RPU8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbed5B2RPU8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbed5B2RPU8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbed5B2RPU8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Zbed5B2RPU8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zbed5B2RPU8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Zbed5B2RPU8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zbed5B2RPU8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zbed5B2RPU8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zbed5B2RPU8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbed5B2RPU8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed5B2RPU8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed5B2RPU8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed5B2RPU8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zbed5B2RPU8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zbed5B2RPU8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Zbed5B2RPU8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zbed5B2RPU8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zbed5B2RPU8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zbed5B2RPU8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zbed5B2RPU8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Zbed5B2RPU8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zbed5B2RPU8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zbed5B2RPU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zbed5B2RPU8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zbed5B2RPU8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed5B2RPU8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed5B2RPU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed5B2RPU8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zbed5B2RPU8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zbed5B2RPU8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zbed5B2RPU8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zbed5B2RPU8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zbed5B2RPU8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zbed5B2RPU8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zbed5B2RPU8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms