Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Plcb2A3KGF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Plcb2A3KGF7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Plcb2A3KGF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Plcb2A3KGF7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Plcb2A3KGF7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Plcb2A3KGF7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Plcb2A3KGF7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Plcb2A3KGF7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Plcb2A3KGF7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Plcb2A3KGF7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Plcb2A3KGF7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Plcb2A3KGF7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Plcb2A3KGF7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Plcb2A3KGF7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Plcb2A3KGF7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Plcb2A3KGF7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Plcb2A3KGF7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Plcb2A3KGF7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Plcb2A3KGF7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Plcb2A3KGF7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Plcb2A3KGF7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Plcb2A3KGF7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Plcb2A3KGF7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Plcb2A3KGF7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Plcb2A3KGF7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Plcb2A3KGF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Plcb2A3KGF7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Plcb2A3KGF7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Plcb2A3KGF7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Plcb2A3KGF7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Plcb2A3KGF7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Plcb2A3KGF7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Plcb2A3KGF7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Plcb2A3KGF7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Plcb2A3KGF7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,45
Plcb2A3KGF7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Plcb2A3KGF7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Plcb2A3KGF7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Plcb2A3KGF7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Plcb2A3KGF7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Plcb2A3KGF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Plcb2A3KGF7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Plcb2A3KGF7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Plcb2A3KGF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Plcb2A3KGF7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Plcb2A3KGF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Plcb2A3KGF7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Plcb2A3KGF7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Plcb2A3KGF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Plcb2A3KGF7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Plcb2A3KGF7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Plcb2A3KGF7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Plcb2A3KGF7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Plcb2A3KGF7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Plcb2A3KGF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Plcb2A3KGF7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Plcb2A3KGF7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Plcb2A3KGF7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Plcb2A3KGF7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Plcb2A3KGF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Plcb2A3KGF7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Plcb2A3KGF7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Plcb2A3KGF7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Plcb2A3KGF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Plcb2A3KGF7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Plcb2A3KGF7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Plcb2A3KGF7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Plcb2A3KGF7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Plcb2A3KGF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Plcb2A3KGF7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Plcb2A3KGF7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Plcb2A3KGF7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Plcb2A3KGF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Plcb2A3KGF7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Plcb2A3KGF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Plcb2A3KGF7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Plcb2A3KGF7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Plcb2A3KGF7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Plcb2A3KGF7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Plcb2A3KGF7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Plcb2A3KGF7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Plcb2A3KGF7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Plcb2A3KGF7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
Plcb2A3KGF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Plcb2A3KGF7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Plcb2A3KGF7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Plcb2A3KGF7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Plcb2A3KGF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Plcb2A3KGF7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Plcb2A3KGF7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Plcb2A3KGF7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2,39
Plcb2A3KGF7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Plcb2A3KGF7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Plcb2A3KGF7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Plcb2A3KGF7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Plcb2A3KGF7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Plcb2A3KGF7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Plcb2A3KGF7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Plcb2A3KGF7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,4 ms