Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Plcb2A3KGF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Plcb2A3KGF7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Plcb2A3KGF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Plcb2A3KGF7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Plcb2A3KGF7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Plcb2A3KGF7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Plcb2A3KGF7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Plcb2A3KGF7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Plcb2A3KGF7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Plcb2A3KGF7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Plcb2A3KGF7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Plcb2A3KGF7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Plcb2A3KGF7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Plcb2A3KGF7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Plcb2A3KGF7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Plcb2A3KGF7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Plcb2A3KGF7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Plcb2A3KGF7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Plcb2A3KGF7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Plcb2A3KGF7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Plcb2A3KGF7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Plcb2A3KGF7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Plcb2A3KGF7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Plcb2A3KGF7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Plcb2A3KGF7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Plcb2A3KGF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Plcb2A3KGF7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Plcb2A3KGF7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Plcb2A3KGF7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Plcb2A3KGF7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Plcb2A3KGF7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Plcb2A3KGF7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Plcb2A3KGF7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Plcb2A3KGF7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Plcb2A3KGF7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Plcb2A3KGF7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Plcb2A3KGF7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Plcb2A3KGF7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Plcb2A3KGF7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Plcb2A3KGF7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Plcb2A3KGF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Plcb2A3KGF7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Plcb2A3KGF7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Plcb2A3KGF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Plcb2A3KGF7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Plcb2A3KGF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Plcb2A3KGF7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Plcb2A3KGF7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Plcb2A3KGF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Plcb2A3KGF7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Plcb2A3KGF7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Plcb2A3KGF7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Plcb2A3KGF7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Plcb2A3KGF7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Plcb2A3KGF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Plcb2A3KGF7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Plcb2A3KGF7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Plcb2A3KGF7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Plcb2A3KGF7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Plcb2A3KGF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Plcb2A3KGF7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Plcb2A3KGF7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Plcb2A3KGF7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Plcb2A3KGF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Plcb2A3KGF7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Plcb2A3KGF7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Plcb2A3KGF7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Plcb2A3KGF7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Plcb2A3KGF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Plcb2A3KGF7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Plcb2A3KGF7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Plcb2A3KGF7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Plcb2A3KGF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Plcb2A3KGF7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Plcb2A3KGF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Plcb2A3KGF7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Plcb2A3KGF7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Plcb2A3KGF7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Plcb2A3KGF7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Plcb2A3KGF7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Plcb2A3KGF7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Plcb2A3KGF7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Plcb2A3KGF7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Plcb2A3KGF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Plcb2A3KGF7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Plcb2A3KGF7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Plcb2A3KGF7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Plcb2A3KGF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Plcb2A3KGF7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Plcb2A3KGF7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Plcb2A3KGF7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Plcb2A3KGF7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Plcb2A3KGF7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Plcb2A3KGF7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Plcb2A3KGF7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Plcb2A3KGF7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Plcb2A3KGF7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Plcb2A3KGF7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Plcb2A3KGF7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms