Protein–RNA interactions for Protein: A2BDP1

Fam155b, Transmembrane protein FAM155B, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam155bA2BDP1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam155bA2BDP1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam155bA2BDP1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam155bA2BDP1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam155bA2BDP1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam155bA2BDP1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam155bA2BDP1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam155bA2BDP1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam155bA2BDP1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam155bA2BDP1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam155bA2BDP1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam155bA2BDP1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam155bA2BDP1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam155bA2BDP1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam155bA2BDP1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam155bA2BDP1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam155bA2BDP1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam155bA2BDP1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam155bA2BDP1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam155bA2BDP1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam155bA2BDP1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam155bA2BDP1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam155bA2BDP1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam155bA2BDP1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam155bA2BDP1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam155bA2BDP1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam155bA2BDP1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam155bA2BDP1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam155bA2BDP1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam155bA2BDP1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam155bA2BDP1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam155bA2BDP1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam155bA2BDP1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam155bA2BDP1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam155bA2BDP1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam155bA2BDP1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam155bA2BDP1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam155bA2BDP1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam155bA2BDP1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam155bA2BDP1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam155bA2BDP1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam155bA2BDP1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam155bA2BDP1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam155bA2BDP1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam155bA2BDP1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam155bA2BDP1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam155bA2BDP1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam155bA2BDP1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam155bA2BDP1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam155bA2BDP1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam155bA2BDP1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam155bA2BDP1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Fam155bA2BDP1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam155bA2BDP1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam155bA2BDP1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam155bA2BDP1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms