Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Patl2A2ARM1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Patl2A2ARM1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Patl2A2ARM1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Patl2A2ARM1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Patl2A2ARM1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Patl2A2ARM1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Patl2A2ARM1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Patl2A2ARM1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Patl2A2ARM1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Patl2A2ARM1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Patl2A2ARM1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Patl2A2ARM1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Patl2A2ARM1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Patl2A2ARM1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Patl2A2ARM1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Patl2A2ARM1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Patl2A2ARM1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Patl2A2ARM1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Patl2A2ARM1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Patl2A2ARM1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Patl2A2ARM1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Patl2A2ARM1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Patl2A2ARM1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Patl2A2ARM1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Patl2A2ARM1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Patl2A2ARM1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Patl2A2ARM1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Patl2A2ARM1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Patl2A2ARM1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Patl2A2ARM1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Patl2A2ARM1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Patl2A2ARM1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Patl2A2ARM1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Patl2A2ARM1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Patl2A2ARM1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Patl2A2ARM1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Patl2A2ARM1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Patl2A2ARM1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Patl2A2ARM1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Patl2A2ARM1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Patl2A2ARM1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Patl2A2ARM1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Patl2A2ARM1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Patl2A2ARM1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Patl2A2ARM1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Patl2A2ARM1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Patl2A2ARM1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Patl2A2ARM1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Patl2A2ARM1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms