Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smurf2A2A5Z6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smurf2A2A5Z6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smurf2A2A5Z6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smurf2A2A5Z6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smurf2A2A5Z6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smurf2A2A5Z6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smurf2A2A5Z6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smurf2A2A5Z6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smurf2A2A5Z6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smurf2A2A5Z6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smurf2A2A5Z6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smurf2A2A5Z6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smurf2A2A5Z6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smurf2A2A5Z6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smurf2A2A5Z6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smurf2A2A5Z6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smurf2A2A5Z6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smurf2A2A5Z6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smurf2A2A5Z6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smurf2A2A5Z6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smurf2A2A5Z6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smurf2A2A5Z6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smurf2A2A5Z6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smurf2A2A5Z6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smurf2A2A5Z6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smurf2A2A5Z6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smurf2A2A5Z6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smurf2A2A5Z6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smurf2A2A5Z6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smurf2A2A5Z6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smurf2A2A5Z6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smurf2A2A5Z6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smurf2A2A5Z6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smurf2A2A5Z6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smurf2A2A5Z6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smurf2A2A5Z6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smurf2A2A5Z6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smurf2A2A5Z6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smurf2A2A5Z6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smurf2A2A5Z6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smurf2A2A5Z6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smurf2A2A5Z6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smurf2A2A5Z6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smurf2A2A5Z6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smurf2A2A5Z6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Smurf2A2A5Z6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smurf2A2A5Z6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smurf2A2A5Z6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smurf2A2A5Z6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smurf2A2A5Z6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smurf2A2A5Z6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smurf2A2A5Z6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smurf2A2A5Z6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smurf2A2A5Z6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smurf2A2A5Z6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smurf2A2A5Z6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smurf2A2A5Z6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smurf2A2A5Z6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smurf2A2A5Z6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smurf2A2A5Z6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smurf2A2A5Z6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smurf2A2A5Z6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smurf2A2A5Z6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smurf2A2A5Z6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smurf2A2A5Z6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smurf2A2A5Z6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smurf2A2A5Z6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smurf2A2A5Z6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smurf2A2A5Z6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smurf2A2A5Z6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smurf2A2A5Z6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms