Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SUT5

4930563M21Rik, RIKEN cDNA 4930563M21 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930563M21RikA0A1L1SUT5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930563M21RikA0A1L1SUT5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930563M21RikA0A1L1SUT5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.8 ms