Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms