Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms