Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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