Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

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Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTC1Q2NKJ3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CTC1Q2NKJ3 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTC1Q2NKJ3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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