Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms