Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms