Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms