Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms