Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms