Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms