Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms