Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms